Câu chuyện được kể như hồi ức của cô gái trẻ Chizuru.

Yukimura Chizuru là nhân vật nữ chính của "Hakuouki", một thiếu nữ chăm chỉ, hiền hoà và tốt bụng. Sáu tháng trước khi câu chuyện thực sự bắt đầu, cha của Chizuru đã từ biệt con gái để lên kinh đô Kyoto công tác. Mới đầu ông viết thư về rất đều đặn, nhưng sau đó ít lâu thì bặt tin luôn. Ở quê nhà lo lắng không yên, Chizuru đã giả trai, mang theo một thanh kiếm katana và quyết đi tìm cha. Đến Kyoto, cô chạm trán với hai tên lãng sĩ côn đồ, bị chúng rượt đuổi trong đêm. Ngay khi chúng sắp bắt được Chizuru, một kẻ mặc đồng phục Shinsengumi đã giết chúng. Người mặc đồng phục nhóm Shinsen nhìn rất đáng sợ với mái tóc trắng tinh cùng ánh mắt đỏ máu, trông không khác gì thây ma. Ngay khi gã sắp kết liễu cả Chizuru, chàng trai mắt xanh dương tên Saito Hajime kịp thời chém chết gã. Một chàng trai khác có cặp mắt xanh lá cây tên Okita Souji cũng xuất hiện ngay lúc đó và nhìn Chizuru bằng nụ cười bí ẩn. Trong khi cô bé chưa kịp định thần, giọng nói lạnh băng của người đàn ông mắt tím - Hijikata Toshizo, cất lên: "Nghe đây, không được chạy! Nếu ngươi quay lưng đi, ta sẽ chém."

Đúng khoảnh khắc ấy, tuyết đầu mùa bắt đầu rơi, mà theo như Chizuru miêu tả, dưới ánh trăng tròn, chúng hệt như những đoá hoa anh đào nở trái mùa vậy.

Chizuru ngất đi vì quá sợ. Thay vì giết Chizuru để giữ bí mật vụ việc, Hijikata – Phó cục trưởng Shinsengumi đã đem cô về doanh trại của nhóm để tra hỏi. Nhờ đó, cô biết được mục tiêu tìm kiếm của Shinsengumi chính là Koudo, cha cô, người đã mất tích khi phòng mạch của ông cháy rụi. Ban lãnh đạo Shinsengumi cho rằng đó là vụ cháy cố ý và thầy thuốc Yukimura Koudo đang bị cuốn vào vụ việc nào đó. Cục trưởng Kondo, phó cục trưởng Hijikata, tổng trưởng Yamanami Keisuke rất bất ngờ khi biết Chizuru là con gái của thầy thuốc Koudo. Họ bảo do cô đã trông thấy những "con quỷ" đêm qua - bí mật tối cao của Shinsengumi, nên bắt buộc Chizuru phải ở lại nhóm để tránh chuyện này lộ ra. Đổi lại, Shinsengumi hứa sẽ bảo vệ cô, giúp cô tìm được cha.

Từ đó, cô bé Yukimura Chizuru bắt đầu cuộc sống mới tại doanh trại Shinsengumi. Và đồng thời, cô cũng dần dần tìm ra sự thật khắc nghiệt bị che giấu về bản thân, cũng như người con trai mình sẽ yêu ở Shinsengumi.